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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
《满江红》带火古城砖 游客争相打卡襄阳古城墙******
襄阳市文化学者给游客讲述岳飞抗金故事 李兴会 摄
中新网襄阳2月3日电 (李兴会 李素文 王晶)随着电影《满江红》的热映，不少观众开始重温南宋抗金那段历史。连日来，游客争相打卡湖北襄阳古城，与城墙上的“岳”字砖拍照留念。
襄阳作为兵家必争之地，在岳飞抗金战争中地位举足轻重。据《宋史·岳飞传》记载，南宋时期，襄阳为京西重地，一度被金兵占领。岳飞上奏高宗：“襄阳为恢复中原之根本，应当先取。”公元1134年，岳飞率军一举收复襄阳，然后在此招兵买马、修筑城墙，使金兵不敢窥视襄阳。
如今，800多年过去了，襄阳仍然流传着岳飞抗金的故事，古城墙上残留着有关岳家军传说的历史印记。临汉门(小北门)城门洞里的“岳”字砖就是其中之一。
自从《满江红》上映后，城门洞里的这块“岳”字砖就成为襄城北街的新晋网红，游客们认为这就是岳家军监制的城砖，纷纷前来拍照。
游客张先生说，看电影之前，还不知道襄阳古城墙上有“岳”字砖。看了众多网友评论后，他也忍不住好奇前来打卡探究。
据襄阳市文化学者介绍，襄城古城墙上的“岳”字砖不只城门洞里的这一块，从临汉门城门洞到古治街的这段城墙上，还有30多块“岳”字砖。
襄阳古城墙上不仅有“岳”字砖。2011年1月，襄阳的文化爱好者曾在襄阳城内的一处建筑废墟上，寻得一方当年岳飞专门烧制的告示性铭文砖。砖的正面从右至左铭刻两行文字：“樁辦城塼，不許借用。”意为战备物资，严禁挪用。
据悉，除了铭文砖，当年岳武穆屯兵襄阳修葺城壁(城墙)楼(城楼)橹(瞭望台)等也在襄阳留下遗迹，现今仍保留有老五中门前的柴场子(柴粮交易之所)、西门外的营盘(驻军之地)、樊城西北郊的官田(官方耕地)等地名。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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